Comptabilité auto-entrepreneur 2026 : obligations et outils
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Comptabilité auto-entrepreneur 2026 : obligations et outils

Le régime de la micro-entreprise impose une comptabilité simplifiée mais pas inexistante. Voici tout ce que vous devez tenir, déclarer et payer pour rester en conformité en 2026.

Comptabilité micro-entreprise mises à jour le 19 mars 2026
2
Registres obligatoires (recettes + achats)
52 €
Pénalité par déclaration manquante
10 ans
Durée de conservation des pièces

Livre des recettes et registre des achats

L'article L. 123-28 du Code de commerce impose aux auto-entrepreneurs de tenir un livre des recettes chronologique. Pour les activités de vente de marchandises, un registre des achats est également obligatoire.

Livre des recettes (obligatoire pour tous)
  • Date de l'encaissement
  • Identité du client (nom ou raison sociale)
  • Nature de la prestation ou du produit vendu
  • Montant encaissé
  • Mode de règlement (espèces, chèque, virement, CB)
  • Référence de la facture ou de la pièce justificative
Registre des achats (vente uniquement)
  • Date de l'achat ou de la dépense
  • Identité du fournisseur
  • Nature de l'achat (matières premières, marchandises)
  • Montant de l'achat
  • Mode de règlement
  • Référence de la facture fournisseur
Conservation des pièces justificatives

Toutes les factures, notes de frais et justificatifs bancaires doivent être conservés pendant 10 ans (article L. 123-22 du Code de commerce). Les pièces peuvent être conservées sous forme numérique à condition de garantir leur intégrité et leur lisibilité.

Déclarations de chiffre d'affaires

La déclaration de chiffre d'affaires est obligatoire, même si votre CA est nul (vous déclarez 0 €). Elle s'effectue en ligne sur autoentrepreneur.urssaf.fr selon la périodicité choisie.

PériodicitéÉchéancesParticularités
MensuelleLe dernier jour du mois suivantMeilleur suivi de trésorerie, lissage des charges
Trimestrielle30/04, 31/07, 31/10, 31/01Option par défaut, moins de formalités

Le chiffre d'affaires déclaré correspond aux encaissements réels de la période (et non aux factures émises). Les cotisations sociales et l'éventuel versement libératoire de l'IR sont calculés automatiquement et prélevés par l'URSSAF.

CFE et impôts locaux

La Cotisation Foncière des Entreprises (CFE) est un impôt local dû par tous les auto-entrepreneurs, quelle que soit l'activité. Son montant est fixé par la commune d'implantation.

Exonération la première année

Tous les auto-entrepreneurs sont exonérés de CFE l'année civile de création de l'activité. La première CFE est due l'année suivante, avec une base réduite de 50 % cette deuxième année.

Exonération si CA < 5 000 €

Depuis la loi de finances 2019, les micro-entrepreneurs dont le CA annuel est inférieur à 5 000 € sont exonérés de la cotisation minimale de CFE. Cette exonération est automatique.

Montant et paiement

La CFE est calculée sur la valeur locative du local professionnel (ou une base minimum fixée par la commune). Pour un auto-entrepreneur sans local dédié, la cotisation minimum varie de 237 € à 573 € (tranche CA < 32 600 €). Le paiement se fait en ligne sur impots.gouv.fr avant le 15 décembre.

Obligations liées à la TVA

En régime de franchise en base (article 293 B du CGI), l'auto-entrepreneur ne collecte pas la TVA et ne la déduit pas. Les obligations TVA apparaissent uniquement en cas de dépassement des seuils ou d'option volontaire.

En franchise de TVA (cas par défaut)

Aucune déclaration de TVA à effectuer. Mention obligatoire sur chaque facture : « TVA non applicable, article 293 B du CGI ». Surveillez vos seuils : 36 800 € (services) et 91 900 € (vente).

En cas de dépassement de seuil

Demandez un numéro de TVA intracommunautaire auprès de votre SIE. Commencez à facturer la TVA. Effectuez vos déclarations CA12 (régime simplifié) ou CA3 (régime normal). Vous pouvez désormais déduire la TVA sur vos achats professionnels.

Cas particulier : achats intracommunautaires

Même en franchise de TVA, si vous achetez des biens à des fournisseurs de l'UE pour plus de 10 000 € par an, vous devez obtenir un numéro de TVA intracommunautaire et effectuer l'autoliquidation de la TVA sur ces achats.

Facturation : les règles à respecter

Toute prestation ou vente supérieure à 25 € doit faire l'objet d'une facture. Les mentions obligatoires sont définies par les articles L. 441-9 et R. 441-4 du Code de commerce.

Mentions obligatoires sur une facture auto-entrepreneur
  • Nom, prénom et adresse de l'auto-entrepreneur
  • Numéro SIRET et code APE (NAF)
  • Mention « EI » ou « Entrepreneur individuel » (obligatoire depuis 2022)
  • Numéro de facture (numérotation chronologique et continue)
  • Date d'émission de la facture
  • Identité et adresse du client
  • Description détaillée de la prestation ou du produit
  • Quantité, prix unitaire HT et montant total HT
  • Mention « TVA non applicable, article 293 B du CGI »
  • Délai de paiement et pénalités de retard
  • Indemnité forfaitaire pour frais de recouvrement : 40 €

Outils recommandés pour la gestion

Plusieurs outils permettent de simplifier la gestion comptable de votre micro-entreprise. Voici les principales catégories :

Logiciels de facturationIndispensable

Henrri (gratuit), Tiime (gratuit), Abby, Freebe : génération de devis et factures conformes, suivi des paiements, livre des recettes automatisé. Indispensable pour respecter les obligations de numérotation et de mentions légales.

Comptes bancaires dédiésRecommandé

Qonto, Shine, Blank (Orange Bank) : compte pro avec catégorisation automatique des dépenses, export comptable, facturation intégrée. Coût : 5 à 15 €/mois. Alternative gratuite : un second compte courant chez votre banque.

Applications de suivi de CAUtile

Mon auto-entreprise (app URSSAF), Superindep, myAE : suivi du CA en temps réel, alertes seuils TVA et plafonds micro-entreprise, rappels de déclarations. Permettent d'anticiper les dépassements.

Archivage des justificatifsRecommandé

Dext, Tiime Receipt, Google Drive : numérisation et archivage des factures fournisseurs et justificatifs. Conservation légale de 10 ans. La numérisation doit garantir l'intégrité du document (format PDF/A recommandé).

Questions fréquentes

Un auto-entrepreneur doit-il avoir un expert-comptable ?

Non, aucune obligation légale n'impose le recours à un expert-comptable pour un auto-entrepreneur. La comptabilité simplifiée (livre des recettes et registre des achats) peut être tenue soi-même. Cependant, un expert-comptable peut être utile pour optimiser votre situation fiscale (choix du versement libératoire, anticipation du dépassement de seuils, passage en société), vérifier la conformité de vos déclarations et vous accompagner en cas de contrôle URSSAF ou fiscal. Le coût moyen est de 500 à 1 500 €/an selon les prestations.

Comment déclarer son chiffre d'affaires quand on est auto-entrepreneur ?

La déclaration de chiffre d'affaires se fait en ligne sur autoentrepreneur.urssaf.fr, mensuellement ou trimestriellement selon l'option choisie à la création. Vous déclarez le CA encaissé (et non facturé) sur la période. Même si le CA est nul, vous devez obligatoirement effectuer la déclaration (déclarer 0 €). En cas de retard, une pénalité de 52 € par déclaration manquante s'applique. La déclaration trimestrielle est due le dernier jour du mois suivant le trimestre (30 avril, 31 juillet, 31 octobre, 31 janvier).

Qu'est-ce que la CFE et combien coûte-t-elle pour un auto-entrepreneur ?

La Cotisation Foncière des Entreprises (CFE) est un impôt local dû par toutes les entreprises, y compris les auto-entrepreneurs. Son montant dépend de la commune et du CA : la base minimale varie de 237 € à 7 046 € selon le CA et la délibération communale. Les auto-entrepreneurs sont exonérés la première année civile d'activité. Le paiement se fait en ligne sur impots.gouv.fr avant le 15 décembre. Depuis 2019, les micro-entrepreneurs dont le CA est inférieur à 5 000 € sont exonérés de la cotisation minimum de CFE.

Faut-il ouvrir un compte bancaire professionnel en auto-entreprise ?

La loi PACTE de 2019 a supprimé l'obligation d'ouvrir un compte bancaire dédié pour les auto-entrepreneurs dont le CA annuel est inférieur à 10 000 € pendant 2 années consécutives. Au-delà de ce seuil, un compte bancaire dédié (pas nécessairement professionnel) est obligatoire. En pratique, un compte courant dédié chez une banque en ligne suffit (Boursorama, Qonto, Shine). Un compte professionnel coûte entre 5 et 30 €/mois et offre des services adaptés (terminaux de paiement, facturation intégrée).

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